>Ca fait des mois que je pense à faire quelque chose sur la chimie organique, qui a occupé au moins 5 ans de ma vie à plein temps…Alors, il faut bien que je me lance. La chimie organique, c’est chiant, c’est une suite de réaction à apprendre par coeur, c’est fait par des chimistes aux blagues fumeuses, qui s’amusent à fabriquer du GHB, du LSD, ou des explosifs dès qu’ils ont 5 minutes.[Pour avoir fait ma thèse avec eux, en ayant déjà deux enfants, donc forcément dans une dynamique profondément différente, j’en ai bavé] . Mais j’y peux rien, la chimie organique, ça m’a plu, ça me plaît. Et puis moi, les réactions, je les ai jamais beaucoup apprises…
Parce qu’en fait, la chimie orga, ça peut se comprendre. Oui oui, on peut comprendre, réfléchir et pas seulement apprendre une grande liste de réaction.(Si, pour le fun, cliquez sur le lien, pour voir ça, c’est trop drôle quand on peut prendre suffisamment de recul…). Et je vais essayer de vous le prouver.
D’abord, une petite question vocabulaire : durant ce qui va suivre, je vais faire preuve d’anthropomorphisme poussé. (Comme les autres chimistes qui n’en n’ont pas toujours conscience) : Tels électrons vont attaquer cet atome, qui est en manque. Tel autre atome a trop d’électrons, donc il s’en débarrasse, etc…
Maintenant, simplement, et rapidement, les bases.
- Les liaisons entre les atomes au sein d’une molécule sont constitués de 2 électrons qui ne sont plus localisé autour d’un seul des 2 atomes, mais localisé entre les deux atomes. [Pour les puristes, la fonction d’onde qui décrit l’électron n’est plus une « orbitale atomique » (solution de l’hamiltonien pour 1 atome), mais une « orbitale moléculaire », combinaison linéaire d’orbitale atomique)]
- Ces liaisons peuvent être polarisées : Il n’y a aucune raison que ces électrons entre les 2 atomes soient, en moyenne, pile au milieu. Si les 2 atomes sont différents, ou ont un environnement différents, ils vont plus ou moins attirer les électrons de la liaison, créant un déséquilibre dans la liaison (un des 2 atomes va ainsi être « appauvri » en électron, l’autre « enrichi »). [il est facile de comprendre les règles qui permettent de prévoir la polarisation des liaisons, on verra sans doute des exemples par la suite]
- Certains atomes gardent des électrons pour eux, sous forme de groupe de 2, appelés doublets non liants : ces électrons ne servent pas à faire des nouvelles liaisons, mais sont suffisamment peu liés au noyau pour pouvoir interagir avec le reste du milieu (avec d’autres molécules par exemple)
- Le nombre de liaisons que fait un atome en condition normale est assez figé : 4 pour le carbone, 3 pour l’azote, 2 pour l’oxygène, 1 pour l’hydrogène
- Lors d’une réaction chimique, ce sont les électrons des liaisons, ou des doublets non liants, qui vont « attaquer » des atomes de l’autre réactif.
Là, on va se la jouer interactif… Dites moi si je continue, ou si je suis en train de vous confirmer que la chimie orga, c’est pas pour vous…
